El sistema de transporte del interior considera las siguientes puertas de ciudad con sus respectivos subsistemas, como parte integral del mismo:

Santander

Cundinamarca

Valle del Cauca

BarrancabermejaSabana de TorresBucaramangaLebrijaGirónFloridablancaPiedecuestaPuerto ParraSebastopolLa BellezaFloríanAlbania

Puerto SalgarRicaurteSimijacaSusaFúqueneCapellaníaGuatancuyUbateCucunubáSutatausaTausaNemocónCoguaChipaqueUneCáquezaQuetameGuayabetalFoscaSoachaBogotá

CartagoAnsermanuevoObandoLa VictoriaLa UniónZarzalRoldanilloCaicedoniaSevillaBugalagrandeAndalucíaTuluáSan PedroBugaGuacaríGinebraEl CerritoPalmiraCandelariaPraderaFloridaYumboCaliJamundí

Antioquia

Boyacá

Tolima

Puerto BerrioMaceoCaracolíYolombóSan RoqueCisnerosSanto DomingoDon MatíasConcepciónGuarneRionegroBarbosaGirardotaCopacabanaBelloMedellínItaguíEnvigadoLa EstrellaSabanetaCaldas

Puerto ServiezVasconiaPuerto BoyacáTununguaBriceñoChiquinquiráCaldasBelénCerinzaCombitaCucaitaDuitamaNobsaPaipaSáchicaSamacáSanta Rosa de ViterboSogamosoSoraSutamarchanTunjaTutaVilla de LeyvaDicatá

HondaMariquitaGuayabalLéridaLíbanoTierra AdentroAmbalemaLa SierraVenadilloAlvaradoPiedrasDoimaIbaguéFlandesGualandayChicoralEspinalGuamoSaldañaOrtegaNatagaimaFresnoHerveo

Caldas

Quindio

Huila

La DoradaVictoriaManzanaresManizalesNeiraVillamariaChinchináPalestina

FilandiaSalentoCircasiaMontenegroQuimbayaCalarcáArmeniaLa Tebadia

AipeNeiva

Casanare

Risaralda

Meta

TauramenaMonterreyAguazulYopalMorichalCusiana

MarsellaSanta Rosa de CabalDos QuebradasPereiraLa VirginiaBalboaLa Celia

AcacíasRestrepoCumaralVillavicencioApiay